Nach Stuttgart führte ihn Babbels Trainerkarriere zu
Hertha BSC, Hoffenheim und dem FC Luzern in die Schweiz. Jede dieser Aufgaben bot besondere Schwierigkeiten und Chancen. Er stabilisierte Hertha BSC und schaffte den Mannschaftsaufstieg in die Bundesliga. Während seiner turbulenteren Zeit in Hoffenheim hatte er jedoch Mühe, konstante Leistungen zu erbringen.
2018 stellte sich Babbel einer neuen Herausforderung, als er nach Australien zog, um die A-League Western Sydney Wanderers zu trainieren. Als seine erste Trainerposition außerhalb Europas war dies eine große Sache. Babbels Zeit in Australien zeigte seine Flexibilität und Offenheit für die Aufnahme anderer Fußballkulturen. Obwohl er sich an eine neue Liga gewöhnen musste, vermittelte er dem Verein sein gewohnt wildes und taktisches Wissen.